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- Centro de Pós-Graduação em Desenvolvimento Agrícola – CPDA 1
- Ciências Agrárias 6
- Ciências Sociais Aplicadas 4
- Clínica e Cirurgia Veterinária 2
- Educação Agrícola 1
- Instituto de Agronomia 1130
- Instituto de Agronomia, 3
- Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde 175
- Instituto de Ciências Biológicas e da Sáude 203
- Instituto de Ciências Exatas 339
- Instituto de Ciências Humanas e Sociais 613
- Instituto de Ciências Sociais Aplicadas 114
- Instituto de Educação 176
- Instituto de Educação / Instituto Multidisciplinar de Nova Iguaçu 2
- Instituto de Florestas 291
- Instituto de Química 1
- Instituto de Tecnologia 372
- Instituto de Três Rios 7
- Instituto de Veterinária 569
- Instituto de Zootecnia 150