@PHDTHESIS{ 2018:368005578,
 	title = {Monitoramento da dispers?o de cepas de Escherichia coli em ambiente de produ??o leiteira},
 	year = {2018},
 	url = "https://tede.ufrrj.br/jspui/handle/jspui/4780",
 	abstract = "A atividade leiteira tem sido de grande import?ncia para economia em todo o mundo e, por esse motivo, cada vez mais os produtores t?m buscado melhorias na qualidade do leite, focando no controle de enfermidades que acometem o rebanho, em especial da mastite bovina. A mastite ambiental pode gerar grandes impactos na bovinocultura leiteira, sendo esta comumente ocasionada por microrganismos como Escherichia coli. Esta esp?cie bacteriana possui heterogeneidade gen?tica e popula??o caracterizada por cepas geneticamente diversificadas, al?m da capacidade de persistir no ambiente de produ??o por tempo prolongado. Frente a esse contexto, o presente estudo teve como objetivo avaliar as rela??es clonais de E. coli em ambiente de produ??o leiteira atrav?s das t?cnicas de tipagem molecular Pulsed Field Gel Eletrophoresis (PFGE) e Multilocus Sequence Typing (MLST), para isso 444 amostras distribu?das entre leite, fezes, ?gua e cadeia produtiva oriundas de uma fazenda localizada no munic?pio de Barra do Pira? no Estado do Rio de Janeiro, Brasil, foram submetidas a testes bioqu?micos e a t?cnica de MALDI-TOF MS para identifica??o bacteriana. Al?m disso, as amostras de ?gua (po?o, a?ude, bebedouro, torneira e riacho) foram submetidas ao teste do N?mero Mais Prov?vel (NMP) para avalia??o de coliforme totais e termotolerantes no qual apresentaram padr?es de potabilidade superiores aos estipulados pelo Minist?rio da Sa?de. De 183 enterobact?rias identificadas, 152 (83%) foram confirmadas atrav?s de ambas as metodologias como E. coli. Destas, nove representantes tiveram o gene gyrB sequenciado para confirma??o molecular da esp?cie apresentando at? 99% de m?xima identidade quando as sequ?ncias foram comparadas com as sequ?ncias do banco de dados NCBI. Posteriormente, todas as 152 cepas de E. coli foram submetidas fenotipicamente a produ??o de biofilme e detec??o de genes de virul?ncia, onde foi poss?vel observar que 41,44% (63/152) de cepas foram produtoras de biofilme, sendo 37,5% (57/152) fraca produdoras, 1,31% (2/152) produtoras moderadas e 2,63% (4/152) fortes produtoras. Al?m disso, foi poss?vel detectar 92, 1% (140/152) de cepas positivas para o gene fimH; 88,8% (135/152) para o gene csgA, 29,6% (45/152) para o gene flu (que s?o genes relacionados ao biofilme) e 13,1% (20/152) positivas para o gene eaeA; 7,2% (11/152) para o gene LT e 2,6% (4/152) para o gene stxI. Nenhuma cepa foi positiva para os genes stxII, ST, ial e eagg. A partir destes resultados, 18 perfis foram estabelecidos com o prop?sito de selecionar 30 cepas que foram processadas no laborat?rio de gen?tica da Universidad Nacional de R?o Cuarto, Argentina, atrav?s da t?cnica PFGE, onde foi poss?vel observar uma elevada variabilidade gen?tica. As cepas que apresentaram de 95% a 100% de similaridade (n=10) foram sequenciadas, a fim de estabelecer uma rela??o clonal entre elas atrav?s da t?cnica de MLST, que gerou oito tipos diferentes de ST, sendo o ST164 e o ST1308 os que estabeleceram poss?veis rela??es clonais entre cepas. Al?m disso, foi observado um novo tipo de sequ?ncia (ST) que dever? ser submetido a um sequenciamento de nova gera??o, e ent?o ser enviado ao curador do MLST para que seja gerado um novo n?mero de ST e depositado no banco de dados do esquema. Ao realizar buscas tanto no banco de dados quanto na literatura, n?o foram encontrados no Brasil relatos sobre os STs (ST5, ST164, ST165 e ST1308) estudados provenientes de cepas de E. coli bovinas, levando ao entendimento de que este trabalho ? o primeiro relato no pa?s.",
 	publisher = {Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro},
 	scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncias Veterin?rias},
 	note = {Instituto de Veterin?ria}
}