@PHDTHESIS{ 2018:836947795,
 	title = {Estudo da microbiota bacteriana endof?tica de cana-dea??car por m?todos independentes de cultivo: diversidade, perfil taxon?mico e predi??o de fun??es de interesse biotecnol?gico},
 	year = {2018},
 	url = "https://tede.ufrrj.br/jspui/handle/jspui/4614",
 	abstract = "A comunidade bacteriana endof?tica ? descrita como aquela capaz de colonizar os tecidos internos das plantas sem causar aparente preju?zo, proporcionando a seus hospedeiros benef?cios para o seu desenvolvimento e prote??o contra pat?genos. Alguns desses mecanismos permanecem pouco compreendidos, principalmente devido ao baixo n?mero de c?lulas bacterianas endof?ticas em compara??o com a planta e dificuldades em acessar o conte?do gen?tico dessa comunidade. Na cana-de-a??car os estudos sobre esta comunidade foram focados principalmente na identifica??o de microrganismos diazotr?ficos. De uma forma geral, trabalhos que visaram descrever esta comunidade foram baseados em metodologias que utilizavam o isolamento dos microrganismos por cultivo. Hoje ? sabido que, devido ? baixa profundidade e cobertura desta metodologia, pode limitar o acesso a estes microrganismos. A introdu??o de abordagens independentes de cultivos tem permitido uma an?lise mais ampla desta comunidade e contribuindo para a compreen??o do papel ecol?gico destes microrganismos na endosfera de seus hospedeiros. O presente trabalho utilizou duas abordagens independentes de cultivo para acessar a comunidade bacteriana na cana-de-a??car. A primeira foi desenvolvida uma metodologia de enriquecimento das c?lulas bacterianas endof?ticas a partir dos tecidos de colmo de cana-de-a??car. Esta abordagem foi baseada em um m?todo de enriquecimento f?sico e n?o direcionado, que ajudou a contornar o alto n?vel de interferentes, como polissacar?deos, compostos fen?licos, nucleases e fibras. A segunda abordagem envolveu o uso do l?quido do apoplasto de colmo da cana-de-a??car. Este nicho tem sido descrito como o principal s?tio de coloniza??o pelos end?fitos. A comunidade encontrada ? rica e diversa, sendo formada por g?neros pertencentes ao grupo das Proteobacterias. Uma das principais Unidades Taxon?micas Operacionais (OTUs) observadas nas an?lises foram classificadas como sendo do g?nero Sphingomonas. A diversidade deste g?nero em cana-de-a??car tamb?m foi avaliada neste estudo, e possivelmente h? a presen?a de novas esp?cies. Foi poss?vel detectar tamb?m a presen?a de bact?rias promotoras de crescimento vegetal, diazotr?ficas e pat?genos-antagonistas. Por meio de uma an?lise preditiva dos poss?veis genes relacionados as principais OTUs detectadas foi poss?vel encontrar genes de interesse biotecnol?gico, aplic?veis em diversas ?reas, sendo os principais envolvidos ? biorremedia??o e o melhoramento do cultivo vegetal. Dessa forma, o presente estudo traz informa??es relevantes ao entendimento da comunidade bacteriana endof?tica de cana-de-a??car e suas fun??es.",
 	publisher = {Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro},
 	scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncia, Tecnologia e Inova??o em Agropecu?ria},
 	note = {Pr?-Reitoria de Pesquisa e P?s-Gradua??o}
}