@PHDTHESIS{ 2018:107086626, title = {Diversidade gen?tica da sequ?ncia 18S do DNA ribossomal de Theileria equi em equinos oriundos das cinco regi?es geogr?ficas do Brasil}, year = {2018}, url = "https://tede.ufrrj.br/jspui/handle/jspui/5618", abstract = "A piroplasmose equina, causada pelo hemoparasito Theileria equi, ? end?mica no Brasil e ? considerada uma das principais doen?as de equinos no mundo. O objetivo do presente estudo foi investigar a diversidade gen?tica de isolados geograficamente distintos de sequ?ncias do gene 18S rRNA de T. equi em equinos naturalmente infectados provenientes das cinco regi?es do Brasil, caracterizar as regi?es hipervari?veis das sequ?ncias 18S rRNA de T. equi deste estudo e elucidar as rela??es taxon?micas entre os isolados de T. equi do Brasil e do mundo. As amostras de sangue dos equinos foram coletadas nas cinco regi?es do pa?s. O DNA gen?mico foi extra?do e as amostras foram submetidas a PCR em tempo real para a sele??o das amostras positivas. Posteriormente, as amostras selecionadas foram submetidas a PCR convencional para a amplifica??o do gene 18S rRNA (~1600 pb) de T. equi, sendo os produtos sequenciados. As sequ?ncias foram alinhadas utilizando o ClustalW, e o alinhamento foi submetido ao m?todo de reconstru??o da M?xima Verossimilhan?a com dist?ncias moleculares estimadas pelo General Time Reversible Model, utilizando 1000 repeti??es. Desse alinhamento foi desenvolvida uma matriz de similaridade e foram observadas as regi?es hipervari?veis. As an?lises filogen?ticas foram realizadas de tr?s formas distintas: utilizando sequ?ncias de T. equi do Brasil, utilizando sequ?ncias de diferentes esp?cies de Theileria e Babesia, e utilizando sequ?ncias de T. equi provenientes de todo o mundo. Foram obtidas vinte e tr?s sequ?ncias parciais do gene 18S rRNA de T. equi, sendo treze delas variantes ?nicas do gene no Brasil. As regi?es do gene hipervari?veis V2, V4 e V8 foram identificadas nas amostras do estudo, sendo a V4 a mais vari?vel. Essas regi?es hipervari?veis foram confirmadas pela an?lise de entropia. Foram identificados dois gen?tipos distintos circulantes nas regi?es do Brasil. Apenas na regi?o Norte foi observado um ?nico gen?tipo, enquanto que nas demais regi?es observaram-se ambos. As amostras se agruparam em dois clados (A e C), estando a maioria das sequ?ncias do estudo agrupadas no clado C. Em outra ?rvore, todas as sequ?ncias de T. equi se agrupam dentro do grupo 1, diferente das demais theilerias e babesias, presentes nos grupos 2 e 3. Em rela??o ?s amostras de T. equi do mundo, tr?s clados foram observados: A, B e C. Este estudo acrescenta importantes informa??es sobre a diversidade g?nica de T. equi em equinos de todas as regi?es do Brasil baseado na sequ?ncia 18S rRNA.", publisher = {Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro}, scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncias Veterin?rias}, note = {Instituto de Veterin?ria} }