@MASTERSTHESIS{ 2013:2144607960, title = {Aplica??o de T?cnicas de REP-PCR na An?lise de Isolados de Staphylococcus aureus em amostras de Mastite Bovina.}, year = {2013}, url = "https://tede.ufrrj.br/jspui/handle/jspui/3470", abstract = "O Staphylococcus aureus ? um importante agente causador de mastite bovina. Est? esp?cie bacteriana possui heterogeneidade gen?tica e uma popula??o caracterizada por estirpes geneticamente diversas. A an?lise da varia??o gen?tica ? uma importante ferramenta para fins de estudos epidemiol?gicos. No presente estudo, foi avaliada a diversidade gen?tica de 56 Staphylococcus aureus isolados de leite bovino mast?tico em sete propriedades da regi?o Sul- Fluminense do Rio de Janeiro atrav?s das t?cnicas de ERIC e (GTG)5-PCR. Foram testados 12 protocolos de ERIC-PCR, sendo selecionados tr?s com maior poder discriminat?rio. Com o protocolo 01, obteve-se 6 agrupamentos com um poder discriminat?rio de 0,863. Observou-se a dispers?o de isolados com similaridade gen?tica em diferentes propriedades e presen?a de cepas clonais circulantes dentro da mesma propriedade e em propriedades de munic?pios diferentes. O protocolo 02 foi gerado afim de melhorar a performance da t?cnica e propiciou a obten??o de15 agrupamentos com um poder discriminat?rio de 0,961, onde foi observada grande diversidade g?nica e variabilidade entre os isolados. No entanto, o protocolo 02 n?o apresentou reprodutibilidade. Desse modo, foi testado um terceiro protocolo, obtendo-se 16 agrupamentos com um poder discriminat?rio de 0,96. A partir deste, tamb?m observou-se a dispers?o de isolados com similaridade gen?tica em diferentes propriedades e presen?a de cepas clonais circulantes em propriedades de munic?pios diferentes. Para a execu??o da t?cnica de (GTG)5- PCR foram testados oito protocolos,elegendo-se apenas um de maior poder discriminat?rio.Este protocolo gerou 15 agrupamentos com um poder discriminat?rio de 0,957. Observou-se a dispers?o de isolados com similaridade gen?tica em diferentes propriedades e presen?a de cepas clonais circulantes em propriedades de munic?pios diferentes. Por?m as tentativas subsequentes de execu??o da t?cnica n?o foram bem sucedidas o que indica a necessidade de ajustes em sua padroniza??o em nosso laborat?rio de maneira a garantir que, uma vez otimizada, possa gerar resultados confi?veis e reprodut?veis. Os resultados obtidos foram comparados com uma tipagem molecular pr?via atrav?s do PFGE que gerou 6 perfis gen?ticos distintos em 19 isolados testados. Apesar de produzirem um n?mero elevado de perfis gen?ticos e um bom poder discriminat?rio, estas t?cnicas apresentaram pouca reprodutibilidade, especialmente quando comparadas com a t?cnica de PFGE.", publisher = {Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro}, scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncias Veterin?rias}, note = {Instituto de Veterin?ria} }