@PHDTHESIS{ 2008:989192043,
 	title = {Estudo te?rico de mecanismos para a etapa de elimina??o da s?ntese do 5-enolpiruvilchiquimato-3-fosfato (EPSP) catalisada pela EPSP sintase de Oryza sativa},
 	year = {2008},
 	url = "https://tede.ufrrj.br/jspui/handle/tede/41",
 	abstract = "Na sexta etapa de rea??o da via do chiquimato, catalisada pela enzima 5-enolpiruvilchiquimato-3-fostato sintase (EPSPS), o fosfoenolpiruvato (PEP) reage com o chiquimato-3-fosfato (S3P) formando o produto 5-enolpiruvilchiquimato-3-fostato (EPSP) com libera??o de fosfato inorg?nico. Como a rota do chiquimato est? ausente em animais, mas ? essencial para plantas e microorganismos, a enzima EPSPS tornou-se um alvo interessante para o desenvolvimento de herbicidas, fungicidas e bactericidas mais eficientes, ambientalmente mais seguros e econ?micos. O herbicida mais usado no mundo, o glifosato, ? um inibidor da EPSPS. Estudos indicam que o mecanismo da s?ntese do EPSP ? composto de uma etapa de adi??o, que forma um intermedi?rio tetra?drico (IT), seguida de uma etapa de elimina??o. Contudo, apesar de muito estudado, o mecanismo enzim?tico ainda n?o est? completamente esclarecido porque resultados experimentais obtidos por diferentes grupos levam a conclus?es contradit?rias. Neste trabalho foi estudado o mecanismo da s?ntese do EPSP por m?todos te?ricos. Inicialmente, foi realizada uma avalia??o do m?todo semi-emp?rico PM3 para a previs?o do estado de protona??o de res?duos de histidinas e lisinas em enzimas, por compara??o com os estados de protona??o obtidos por difra??o de n?utrons. O m?todo foi ent?o aplicado para prever os estados de protona??o de lisinas e histidinas localizadas no s?tio ativo da EPSPS. Foi constru?do um modelo da EPSPS de uma planta, Oryza sativa, aplicando o m?todo de modelagem por homologia. Foram usadas a seq??ncia prim?ria da EPSPS de O  sativa e duas estruturas cristalogr?ficas da enzima de Escherichia coli, como moldes. Ap?s a constru??o do modelo, foram feitas simula??es computacionais da etapa de elimina??o da rea??o envolvendo todos os amino?cidos e mol?culas de ?gua do s?tio ativo, incluindo o efeito do solvente. Os resultados permitem concluir que o mecanismo mais prov?vel para essa rea??o envolve a participa??o de um res?duo de lisina (Lys432) como catalisador ?cido e de um res?duo de aspartato (Asp334), como catalisador b?sico da etapa de elimina??o. Estudos realizados com uma fosforilidrazona sintetizada por nosso grupo, e que apresentou atividade inibit?ria para o crescimento de sementes, indicam que esse composto interagiria de modo bastante favor?vel com o s?tio ativo da EPSPS de O. sativa.",
 	publisher = {Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro},
 	scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Qu?mica},
 	note = {Instituto de Ci?ncias Exatas}
}